Манґекьо Шарінґан — вища форма Шарінґана, що пробуджується лише в небагатьох представників клану Учіха, які пережили травматичне потрясіння, як правило пов'язане із загибеллю найдорожчої людини. Візерунок томое в оці перетворюється на унікальний для кожного носія малюнок, що нагадує лопаті вертушки. Ці очі називають «небесними очима, що без перешкод бачать істину всього сущого».
Окрім збереження та посилення всіх базових здібностей Шарінґана, Манґекьо Шарінґан дарує власнику могутні унікальні додзюцу, які зазвичай відрізняються для лівого та правого ока. Так, Ітачі Учіха володів Аматерасу та Цукуйомі, Саске Учіха — Аматерасу та Каґуцучі, що дозволяє керувати формою чорного полум'я, Обіто Учіха та Какаші Хатаке — просторово-часовим Камуі, а Шісуі Учіха — Котоамацукамі, досконалим ґендзюцу навіювання. Той, хто опанував сили Манґекьо в обох очах, отримує доступ до Сусаноо — гігантського аватара з чакри. Деякі носії, як Мадара та Саске, мають «пряме томое», що дарує підвищену змінність рухів у бою.
Кожне застосування технік Манґекьо викликає колосальне навантаження: витрачається величезна кількість чакри, тіло пронизує болісний біль, а зір незворотно падає, і надмірне використання веде до повної сліпоти. Повернути втрачене світло здатна лише пересадка очей кровного родича, в ідеалі рідного брата, що утворює Вічний Манґекьо Шарінґан. Учіха також можуть програмувати спрацьовування технік Манґекьо за певних умов, і ця програма залишається активною навіть після смерті творця.
Пересаджений Манґекьо Шарінґан може використовуватися не Учіха, причому вони здатні вільно вмикати та вимикати його, хоча витрати чакри для них відчутно вищі, ніж для істинного носія. Крім того, Манґекьо дозволяє глибше розшифровувати кам'яну скрижаль клану Учіха, відкриваючи знання, недоступні звичайному Шарінґану.
