Учіха Мадара є одним із найвищих майстрів ніндзюцу в історії шинобі, чiji здатності у 25 років вже перевершували практично всіх живучих воїнів. Як представник клану Учіха, він досяг немовірних висот у використанні стихії вогню — його техніки Катон були настільки потужними, що здатні були покривати великі території вогнем, не вимагаючи при цьому складних пломб. Мадара віртуозно володів як базовими техніками вогню, так і розробив власні унікальні варіації, які демонстрували повний контроль над пожежною стихією.
Відрізняючись від багатьох представників свого клану, Мадара мав здатність використовувати стихію Інь, що дозволяло йому створювати иллюзії та маніпулювати тіневою енергією. Ця здатність поєднувалася з його гениальним гендзюцу, роблячи його майже непереможним суперником у ментальному протиставленні. Однак справжня сила Мадари розкривалася завдяки його унікальним очам додзюцу.
Маючи Мангекё Шаринган, Мадара отримав доступ до технік, недоступних звичайним користувачам Шарингана. Він міг використовувати Сусаноо — великого воїна із чакра, який має немовірну руйнівну силу. Аже неповна форма Сусаноо дозволяла йому битися на рівні з цілими арміями шинобі, а повна форма робила його практично непробиваним. Бувальше, Мангекё Шаринган надав йому унікальні техніки, специфічні саме для його очей.
Майстерство Мадары у тайдзюцу та букідзюцу доповнювало його ніндзюцу арсенал. Він віртуозно володів варісом — традиційною зброєю клану Учіха, здатною відбивати та підсилювати техніки вогню. Його бойовий стиль поєднував собою потужні дальні техніки з ніроговою швидкістю та силою ближнього бою. Мадара міг використовувати зброю з такою точністю, що металеві веера ставали смертельними навіть на великих відстанях.
