大蛇丸の呪印の術は、大蛇丸が重吾の体の研究に基づいて生み出した禁術である。彼は重吾の体液から特殊な酵素を抽出し、それを自身の仙術チャクラと混ぜ合わせることで、他者に付与できる印を作り出した。印は通常、首への噛みつきによって施され、その後、体が印を受け入れるか拒絶するまで、その人物は意識を失う。適合率はおよそ十パーセントであり、体が印を受け入れない者は死亡する。大蛇丸はこれらの印を、強い部下か、将来の器と見なす者に施す。
活性化した印は、宿主自身のチャクラを引き出し、それを大蛇丸の仙術チャクラに置き換えることで、チャクラ量を十倍に増やし、すべての術を強化する。第一段階では、印の模様が体に広がり、強い痛みを引き起こすが、その痛みは時間とともに鈍くなる。熟練した使用者は、模様の広がりの程度を制御できる。第二段階では、身体的な変容が起こる。虹彩は黄色くなり、強膜は黒くなり、肌の色が変わり、髪は伸び、力は大幅に増大する。しかし、第二段階を長時間使用すると、精神と肉体が侵食され、狂気に至る。
印を除去することはほぼ不可能であり、多くの場合、単に抑圧されるだけである。大蛇丸は意図的に自身の意識の一部を各印に残しているため、少なくとも一つの印が存在する限り、彼は完全には死ぬことができない。
