穢土転生状態において、長門は完全な明晰さとすべての記憶を保っており、これが彼の立場を特に苦しいものにしている。彼は自身が道具として利用されていることを自覚しており、カブトが行動を支配している限り抵抗する術がない。それでも彼は自分に忠実であり、ナルトがついに九尾を制御することを心から喜んでいる。それに驚いていないのは、二人とも自来也に師事していたことを知っているからだ。戦わせる者たちに対して憎しみは抱かず、戦いのさなかでさえ敵を助けることを試み、自らの術の中和に関するアドバイスを与えようとする。
彼の中には生きてきた人生への深い倦怠と、なし得たことへの後悔が感じられる。彼は自分の道が誤っていたことを理解しており、死後になって何らかの形で罪を償いたいと願っている。彼の言葉は預言的になる。彼はナルトの中に自来也の志の継承を見て、ナルトこそが師にも自分にもできなかったことを成し遂げられると信じている。カブトが彼の人格を抑圧した瞬間、長門は自らの意志で話し行動する能力を失い、無感情な兵器と化す。しかしイタチが彼を支配から解放すると、彼は再び自分自身を取り戻し、希望に満ちた笑顔でナルトと別れを告げる。