Le Mode Ermite est un senjutsu atteint en mélangeant l'énergie naturelle avec la chakra physique et spirituelle de l'utilisateur, ce qui donne naissance à la chakra senjutsu. L'apprentissage de cet art est assuré par les crapauds du mont Myôboku et les serpents de la grotte de Ryûchi. Pour le maîtriser, il faut des réserves de chakra exceptionnellement importantes et un corps suffisamment robuste, capable de supporter la puissance accrue. Pendant la collecte de l'énergie naturelle, il faut conserver une immobilité totale, sinon l'énergie ne sera pas acceptée ; le moindre excès menace d'une transformation irréversible en pierre, tandis qu'un manque empêchera d'activer le mode. Les crapauds utilisent une huile spéciale pour absorber passivement l'énergie et un bâton qui l'expulse en cas de danger ; le sage serpent injecte l'énergie naturelle par une morsure, et le corps soit accepte la force, soit il est dévoré.
Le Mode Ermite activé démultiplie la force physique, la vitesse, l'endurance, les réflexes, la perception et la robustesse, et accroît aussi la puissance du ninjutsu, du genjutsu et du taijutsu. L'utilisateur acquiert la capacité de ressentir la chakra et les attaques sans l'aide de la vue, et l'énergie naturelle qui l'entoure peut devenir un prolongement du corps (chez les crapauds) ou insuffler la vie à des objets inorganiques (chez les serpents). Si un adversaire tente d'absorber la chakra, l'excès d'énergie naturelle peut le transformer en pierre. L'apparence change : une pigmentation sombre apparaît autour des yeux, et les iris prennent une teinte caractéristique selon l'école. Jiraiya, incapable d'équilibrer parfaitement les énergies, acquérait des traits de crapaud — un nez élargi, des verrues, des dents acérées et des membres palmés, ce qui augmentait sa manœuvrabilité. Naruto Uzumaki obtient des iris jaunes aux pupilles horizontales et un contour des yeux orange ; Hashirama Senju — des iris jaunes et une pigmentation noire allant jusqu'aux oreilles, avec une marque ronde sur le front ; Minato Namikaze — des iris jaunes, des pupilles de crapaud et une pigmentation orange.
Le principal inconvénient est l'impossibilité de reconstituer la chakra senjutsu en mouvement, ce qui limite la durée d'action. Cet inconvénient est contourné grâce à la fusion avec des crapauds sur les épaules, qui collectent la chakra, à des clones d'ombre accumulant l'énergie à l'écart, ou à l'incorporation de l'ADN de Jûgo pour une absorption passive, comme l'a fait Kabuto Yakushi. Un entraînement constant réduit le temps d'absorption, et les jinchûriki en harmonie avec leur bête peuvent entrer en mode en quelques secondes.
