La régénération du Jinchûriki est une capacité passive que possèdent les jinchûriki grâce au chakra de la bête à queue scellée en eux. Naruto Uzumaki, étant le porteur de Kurama, a obtenu une guérison passive accélérée des blessures. Dans son état normal, elle se manifeste par une rapide restauration des tissus : la coupure sur la paume infligée par un kunai se refermait à vue d'œil, et Kakashi Hatake remarqua la vitesse inhabituelle de la cicatrisation. Naruto attribuait même à tort l'effet à la pommade que lui avait donnée Hinata, alors qu'en réalité les blessures se refermaient grâce au chakra du Kyûbi. En combat, en particulier lors de l'utilisation du chakra de Kurama ou sous des formes transformées, la régénération s'intensifie : la blessure du Chidori qui avait transpercé son épaule s'est refermée après l'entrée en mode. Dans la version 2, la régénération restaure en permanence les dommages que le chakra corrosif inflige lui-même, mais ce cycle de destruction et de restauration des cellules réduit, à long terme, l'espérance de vie. Les autres jinchûriki possèdent également une capacité semblable, mais son intensité dépend de la bête et du contrôle exercé sur sa puissance.
