En mode sage, Kabuto est enfin convaincu qu'il est devenu un «être parfait», ayant surpassé Orochimaru. Il parle de lui comme d'un dragon ayant perdu sa peau de serpent. Sa confiance en soi atteint son apogée : il se considère comme le plus proche du pouvoir du Sage des Six Chemins. Il obtient sans compromis de la reconnaissance et est prêt à éliminer quiconque se mettrait en travers de son chemin. Lors de sa conversation avec Itachi et Sasuke, il tente de les manipuler, trouvant des points communs, il rappelle la trahison de Konoha, la fausse identité. Mais lorsque sa supériorité est remise en question, il tombe dans le désespoir et commence à osciller entre fierté et incertitude. Kabuto conserve néanmoins son calcul et son génie tactique, utilisant les aptitudes du Quintet du Son, de Jugo et des autres. Cependant, son esprit est obscurci par l'obsession de devenir quelqu'un de nouveau, et il ne peut pas s'accepter tel qu'il est. C'est précisément cette aveuglement intérieur qui le rend vulnérable face à l'Izanami. Malgré tout, il continue de s'adresser à Orochimaru avec respect (‑sama), montrant son incapacité à rompre totalement le lien avec son passé.