La Técnica del Clon de Sombra es un ninjutsu de clonación creado por Tobirama Senju. A diferencia de las copias ilusorias de la Técnica de Clonación básica, los clones de sombra son materiales: copian la ropa, el equipo y el estado físico del usuario en el momento de la creación. El chakra se distribuye equitativamente entre el original y cada clon: un clon recibe la mitad de la reserva, dos clones un tercio cada uno, y así sucesivamente. Tal agotamiento rápido de las reservas hace que la técnica sea peligrosa para los shinobi con poco volumen de chakra, por lo que solo los poseedores de nivel jōnin o superior pueden usarla de forma segura. Naruto Uzumaki es una excepción gracias al acceso al chakra del Nueve Colas y puede crear cientos de clones sin daño aparente.
Los clones de sombra son indistinguibles del original tanto visualmente como por su firma de chakra, aunque Uchiha Madara es capaz de reconocerlos. Poseen su propia reserva de chakra y pueden ejecutar técnicas, incluyendo la creación de nuevos clones de sombra. Al disiparse —por un golpe o por voluntad del usuario— toda la experiencia acumulada y el chakra restante se transfieren instantáneamente al original. Esta propiedad se utiliza activamente para el reconocimiento: un clon se infiltra en territorio enemigo, cumple la misión y se disipa, transmitiendo al original la información obtenida.
Kakashi Hatake descubrió que los clones de sombra pueden acelerar el aprendizaje: una hora de entrenamiento con un clon proporciona dos horas de experiencia al disiparse, y cientos de clones pueden comprimir semanas de práctica en horas. Sin embargo, el colosal gasto de chakra y la acumulación de fatiga hacen que este método sea accesible prácticamente solo para Naruto.
En combate, los clones sirven para distraer, rodear y abrumar con superioridad numérica. Entre el original y los clones se mantiene un vínculo sutil que permite coordinar las acciones.