Técnica del Clon de Sombra - un ninjutsu de clonación creado por Tobirama Senju. A diferencia de las copias ilusorias de la Técnica de Clonación básica, los clones de sombra son materiales: copian la ropa, el equipamiento y el estado físico del usuario en el momento de la creación. El chakra se distribuye equitativamente entre el original y cada clon - un clon recibe la mitad de la reserva, dos clones un tercio cada uno, y así sucesivamente. Tal rápido agotamiento de las reservas hace que la técnica sea peligrosa para los shinobi con poco volumen de chakra, por lo que solo los poseedores de nivel jōnin y superior pueden aplicarla de forma segura. Naruto Uzumaki es una excepción gracias al acceso al chakra del Nueve Colas y puede crear cientos de clones sin daño aparente.
Los clones de sombra son indistinguibles del original visualmente y por la firma de chakra incluso para los dōjutsu, aunque Uchiha Madara es capaz de reconocerlos. Poseen su propio chakra y pueden realizar técnicas, incluyendo la creación de nuevos clones de sombra. Al disiparse - por un golpe o por voluntad del usuario - toda la experiencia acumulada y el resto de chakra se transmiten instantáneamente al original. Esta propiedad se utiliza activamente para la recopilación de información: un clon se infiltra en territorio enemigo, cumple la tarea y se disipa, transmitiendo al dueño la información obtenida.
Kakashi Hatake descubrió que los clones de sombra pueden acelerar el aprendizaje: una hora de entrenamiento con un clon da dos horas de experiencia tras su disipación, y cientos de clones comprimen semanas de práctica en horas. Sin embargo, el colosal gasto de chakra y la acumulación de fatiga hacen que este método sea accesible prácticamente solo para Naruto.
En combate, los clones sirven para distraer, rodear y suprimir con superioridad numérica. Entre el original y los clones se mantiene un vínculo sutil que permite coordinar las acciones.