Susanoo es la habilidad más poderosa disponible para quien ha despertado el Mangekyō Sharingan y ha dominado su poder en ambos ojos, transmitiéndose en el clan Uchiha de generación en generación. Materializa un guardián humanoide gigante a partir del chakra del usuario, que rodea al portador y actúa como una extensión de su voluntad: ataca, defiende y aplica técnicas. Susanoo se desarrolla por etapas: primero aparece una estructura esquelética, luego surgen músculos y piel, se forma un torso completo, y en etapas avanzadas se añaden armadura, piernas y, finalmente, el colosal Susanoo Completo, que alcanza el tamaño de una bestia con cola y adquiere alas para volar.
La activación de la técnica requiere un gasto colosal de chakra y provoca una sensación de dolor en cada célula del cuerpo, que se intensifica al pasar a formas más completas. Susanoo puede selectivamente dejar pasar a través de sí los ataques del propio usuario y de sus aliados, pero no se regenera al sufrir daños: la recuperación solo es posible disipándolo y reformándolo, o avanzando a la siguiente etapa. La protección física es prácticamente absoluta, sin embargo, la técnica no protege contra ataques que afectan directamente los sentidos, como ondas sonoras o genjutsu. Además, en etapas sin piernas manifiestas, la parte inferior del cuerpo sigue siendo vulnerable, pudiendo alcanzarse bajo el Susanoo, por ejemplo, desde debajo de la tierra, y un enemigo que logre aferrarse al usuario puede sacarlo de debajo de la protección.
Cada portador del Mangekyō obtiene una manifestación única en color, apariencia y armamento. Itachi Uchiha poseía la Espada Totsuka, que sella todo lo que atraviesa, y el Espejo Yata, que cambia sus propiedades para reflejar cualquier ataque. Sasuke Uchiha está armado con un arco y flechas, cuyas propiedades pueden potenciarse con llamas negras o rayos; su Susanoo Completo adquiere un casco demoníaco con una larga nariz de tengu. Madara Uchiha utilizó un Susanoo de dos caras con cuatro brazos y cuchillas curvas capaces de lanzarse contra el enemigo. El Susanoo Completo de Madara, con una sola katana, partía picos montañosos a distancia. También se sabe que Indra Ōtsutsuki, Kakashi Hatake y Hagoromo Ōtsutsuki emplearon este poder, y el Susanoo de Kakashi se distinguía por cicatrices que repetían las heridas de su portador.
