Orochimaru es un genio cuyo carácter se formó bajo la influencia de la muerte temprana de sus padres y los horrores de la Segunda Guerra Mundial ninja. Tsunade lo llama «corrupto» incluso en su infancia. Su objetivo principal es conocer todos los secretos del mundo y dominar todas las técnicas, para lo cual aspira a la inmortalidad. Desprecia la fragilidad de la vida humana y considera que solo la eternidad permitirá alcanzar el verdadero conocimiento. En él se desarrolló un complejo de divinidad: valora únicamente a sí mismo y a quienes sirven a sus objetivos. Trata a sus subordinados como material desechable, pero al mismo tiempo puede mostrar un interés sincero en su desarrollo si ve potencial. Orochimaru es sádico, le gusta sembrar el miedo y observar el sufrimiento de los demás, pero lo hace no por simple crueldad, sino por curiosidad científica. Es arrogante y tiende a subestimar a sus adversarios, lo que a veces conduce a consecuencias graves (como en la batalla con Itachi o con Hiruzen). Al mismo tiempo, posee una mente perspicaz y un pensamiento estratégico. La traición le resulta natural: sin dudarlo mató al Cuarto Kazekage para manipular a Sunagakure, y abandonó Akatsuki cuando comprendió que no podía obtener el cuerpo de Itachi. Su actitud hacia Sasuke es una mezcla de admiración por su genio y un deseo depredador de apoderarse de su cuerpo. Orochimaru es un coleccionista de «ejemplares raros»: personas con habilidades únicas (Kimimaro, Jūgo, Sasuke), a quienes acumula como recursos.
