宇智波止水在忍术方面具有卓越的能力，因此获得了「瞬身之止水」的绰号，「瞬身移动的止水」。
瞬身移动之术（瞬身之术）
止水的主要专长，使他成为传奇。凭借对查克拉的卓越掌握以及掌握所有五种基本性质变化，他能够在巨大的距离上移动，留下仅有的绿色痕迹。他的移动速度如此之快，以至于对手甚至来不及注意他的动作。
遁术
作为宇智波氏真正的代表，止水精通火遁。他的标志性技能是火遁·豪火球（卡顿：豪火满月曲），能够创造出能够同时摧毁多个目标的巨大火焰墙。他还使用了氏族的经典技能：豪火球和火龙。
万花筒写轮眼及独特能力
觉醒万花筒写轮眼后，止水获得了使用世界上最强大技能之一——伊邪那岐的能力。这是一种独特的幻术，能够向目标灌输任何思想，完全控制其思想，而受害者仍然相信自己是出于自愿行动。这一能力不需要目光接触，并且绝对不易察觉。
武器使用
止水熟练使用苦无和手里剑，将其与瞬身移动术结合进行闪电般的攻击。他也精通使用刀剑，这从他参加ANBU任务中可以得到证明。
