在此期间，大蛇丸依旧保持着同样施虐狂的性格和对不朽的执着，但被剥夺使用忍术的能力对他自尊心造成了严重打击。他的主要弱点是不动摇的傲慢，正是这种傲慢导致了这样的结果：他本想让飛段受苦，而不是速战速决。现在他只能依赖部下（卡布托、佐助、动画中的红莲）执行他的命令，而他自己暂时无法充分战斗。他依旧背信弃义且愤世嫉俗：杀死了四代目风影，操控佐助，将卡布托作为卧底送入晓组织，但与此同时，他对培养部下仍保持真诚的兴趣。他对佐助的耐心不仅源于对写轮眼的渴望，还源于对超越他同龄人的天才的钦佩。大蛇丸仍是“罕见标本”的收藏家，继续进行实验，但身体上的限制迫使他通过中间人行事。他的主要目标是等待新的身体（佐助），为此他愿意付出一切。傲慢 natomiast并未消失：即使双手被封印，他仍相信自己的优越性，这最终导致了对佐助的夺取尝试和失败。
