在童年时期，大蛇丸就已经给人留下「腐败」的印象 — — 据纲手所说，他从一开始就是如此。父母的死亡留下了深深的伤痛：他变得沉默寡言， raramente 分享自己的感受，但同时又表现出超出年龄对生死问题的兴趣。正是在这段时间里，他在父母的坟前发现了一条白蛇，而飞段关于白蛇象征重生和好运的话语点燃了他对探寻世界所有秘密的狂热渴望。自来也后来推测，大蛇丸走上这条路是为了掩盖失去的痛苦。即便那时，他已经展现出天赋：在同龄人中脱颖而出，快速掌握忍术，并表现出分析型思维。与此同时，他的残忍和愤世嫉俗也开始显露 — — 这些品质并不常见于普通儿童 — — 他能够冷静评估局势并提出激进的解决方案（例如后来在战争期间，他提议杀死三个来自雨之国的孤儿，以免制造麻烦）。在与自来也和纲手组成的团队中，他保持着疏离，但他们很快承认了他在天赋上的优势。大蛇丸那时就认为，为了获取知识，可以不惜违背任何规则，尽管在这种情况下年纪尚幼，这仍未发展为公开的犯罪行为。
