У воскресеному стані Нагато зберігає повну ясність розуму та всі свої спогади, що робить його становище особливо мученним. Він усвідомлює, що його використовують як знаряддя, і не має можливості чинити опір, поки Кабуто контролює його дії. Незважаючи на це, він залишається вірним собі: він щиро радий бачити, що Наруто нарешті здобув контроль над Дев'ятихвостим, хоча й не здивований цьому, знаючи, що вони обидва вчилися у Джирайї. Він не відчуває ненависті до тих, хто змушує його битися, і навіть у розпалі битви намагається допомагати противникам, даючи їм поради щодо нейтралізації своїх же технік.
У ньому відчувається глибока втома від прожитого життя та каяття про вчинене. Він розуміє, що його власний шлях був помилковим, і тепер, після смерті, хоче хоч чимось спокутувати свою провину. Його слова стають пророчими: він бачить у Наруто продовження справи Джирайї і вірить, що саме Наруто зможе завершити те, що не вдалося ні вчителеві, ні йому самому. В момент, коли Кабуто придушує його особистість, Нагато втрачає здатність говорити та діяти за своєю волею, перетворюючись на бездушну зброю. Але після того як Ітачі звільняє його від контролю, він знову знаходить себе та прощається з Наруто з надією та усмішкою.