Техника Теневого Клонирования - клонирующее ниндзюцу, созданное Тобирамой Сенджу. В отличие от иллюзорных копий базовой Техники Клонирования, теневые клоны материальны: они копируют одежду, снаряжение и физическое состояние пользователя на момент создания. Чакра распределяется поровну между оригиналом и каждым клоном - один клон получает половину запаса, два клона по трети, и так далее. Такое стремительное истощение резервов делает технику опасной для шиноби с малым объёмом чакры, поэтому безопасно применять её способны лишь обладатели уровня джонина и выше. Наруто Узумаки является исключением благодаря доступу к чакре Девятихвостого и может создавать сотни клонов без видимого ущерба.
Теневые клоны визуально и по сигнатуре чакры неотличимы от оригинала даже для додзюцу, хотя Учиха Мадара способен их распознавать. Они обладают собственной чакрой и могут выполнять техники, включая создание новых теневых клонов. При рассеивании - от удара или по воле пользователя - весь накопленный опыт и остаток чакры мгновенно передаются оригиналу. Это свойство активно используется для сбора разведданных: клон проникает на вражескую территорию, выполняет задачу и рассеивается, передавая хозяину полученную информацию.
Какаши Хатаке обнаружил, что теневые клоны способны ускорять обучение: час тренировки с одним клоном даёт два часа опыта после его рассеивания, а сотни клонов сжимают недели практики в часы. Однако колоссальный расход чакры и накопление усталости делают такой метод доступным практически одному Наруто.
В бою клоны служат для отвлечения, окружения и подавления числом. Между оригиналом и клонами сохраняется тонкая связь, позволяющая координировать действия.