В этот период Кабуто окончательно теряет ориентиры. Смерть Орочимару, за которым он следовал много лет, оставляет его без идентичности. Он сам признаётся, что не знает, кто он, и решает пойти по пути Наруто — создать себя заново, но не через признание, а через силу. Он стремится превзойти Орочимару, впитав его останки и став сильнее. Кабуто становится ещё более расчётливым, циничным и манипулятивным. Он готов использовать любые средства, чтобы достичь цели, включая шантаж и угрозы. Он холодно торгуется с Тоби, требуя Саске в обмен на помощь воскрешёнными ниндзя. При этом внутри него всё ещё теплится благодарность — он дарит Наруто книгу с информацией об Акацуки в знак признательности за то, что тот указал ему путь. Кабуто одержим идеей стать «совершенным существом», но эта одержимость всё ещё не перешла в полное безумие. Он сохраняет аналитический склад ума, спокойствие и даже некоторую вежливость, хотя и с оттенком превосходства.