После того как из него извлекли хвостатых, Обито лежит на земле, полностью обессиленный. Его тело и разум сломлены, но именно в этот момент к нему возвращается истинное «я» — тот мальчик, который мечтал стать Хокаге и верил в товарищей. Он больше не называет себя «никем». Он признаёт, что был неправ, и испытывает глубочайшее чувство вины за все свои злодеяния. Обито больше не стремится к Бесконечному Цукиёми, он хочет искупить свою вину. Он решает пожертвовать жизнью, чтобы воскресить убитых им людей с помощью Рино-Тэнсэй, но Чёрный Дзэцу перехватывает контроль и заставляет его воскресить Мадару. Даже после этого Обито не сдаётся: он крадёт часть чакры хвостатых у Мадары, чтобы спасти умирающего Наруто. В финальной битве с Кагуей Обито действует спокойно и целеустремлённо, уже не руководствуясь ненавистью, а лишь желанием защитить тех, кто остался. Перед смертью он улыбается и находит покой, воссоединяясь с Рин в загробном мире. Его последний поступок — передача силы своих Мангекё Какаши — показывает, что он наконец вернулся к своему первоначальному пути шиноби.