Саннин

В этот период Орочимару уже проявляет черты, которые позже назовут «испорченными». Цунаде отмечает, что он был таким с детства. Смерть родителей оставила глубокий след: он нашёл белую змею у их могилы, и слова Хирузена о перерождении и удаче подтолкнули его к изучению тайн жизни и жажде овладеть всеми техниками. Дзирайя предполагал, что этот путь стал для Орочимару способом забыть боль. На войне он проявляет выдающуюся жестокость и прагматизм: когда они с Дзирайей и Цунаде находят троих сирот из Амегакуре, он предлагает убить их из милосердия, в то время как Дзирайя берётся их тренировать. Он начинает видеть в людях расходный материал или объекты для изучения, но при этом сохраняет интерес к развитию тех, кто обладает уникальными способностями. В нём крепнет чувство собственного превосходства как гения, которого признаёт даже Хаширама. Однако его гордыня ещё не переросла в открытое безумие — он продолжает служить Конохе, выполняя миссии и даже рассматривается как кандидат на пост Четвёртого Хокаге (наряду с Минато). Внутри уже зреет убеждение, что ради знания можно жертвовать любыми нормами, и он начинает тайные эксперименты на людях. Его отношения с учителем Хирузеном остаются внешне почтительными, но он уже считает старые устои ограничивающими.