В воскрешённом состоянии Нагато сохраняет полную ясность ума и все свои воспоминания, что делает его положение особенно мучительным. Он осознаёт, что его используют как орудие, и не имеет возможности сопротивляться, пока Кабуто контролирует его действия. Несмотря на это, он остаётся верен себе: он искренне рад видеть, что Наруто наконец обрёл контроль над Девятихвостым, хотя и не удивлён этому, зная, что они оба учились у Джирайи. Он не испытывает ненависти к тем, кто вынуждает его сражаться, и даже в разгар битвы пытается помогать противникам, давая им советы по нейтрализации своих же техник.
В нём чувствуется глубокая усталость от прожитой жизни и сожаление о содеянном. Он понимает, что его собственный путь был ошибочным, и теперь, после смерти, хочет хоть чем-то искупить свою вину. Его слова становятся пророческими: он видит в Наруто продолжение дела Джирайи и верит, что именно Наруто сможет завершить то, что не удалось ни учителю, ни ему самому. В момент, когда Кабуто подавляет его личность, Нагато теряет способность говорить и действовать по своей воле, превращаясь в бездушное оружие. Но после того как Итачи освобождает его от контроля, он вновь обретает себя и прощается с Наруто с надеждой и улыбкой.