Technika Cieniowanego Klonowania - klonujące ninjutsu stworzone przez Tobiramę Senju. W przeciwieństwie do iluzorycznych kopii podstawowej Techniki Klonowania, cieniowane klony są materialne: kopiują ubranie, ekwipunek i stan fizyczny użytkownika w momencie stworzenia. Czakra jest dzielona równo między oryginałem a każdym klonem - jeden klon otrzymuje połowę zapasu, dwa klony po jednej trzeciej, i tak dalej. Tak gwałtowne wyczerpanie rezerw czyni tę technikę niebezpieczną dla shinobi z małą ilością czakry, dlatego bezpiecznie mogą ją stosować jedynie posiadacze poziomu jōnina i wyżej. Naruto Uzumaki jest wyjątkiem dzięki dostępowi do czakry Dziewięcioogoniastego i może tworzyć setki klonów bez widocznego uszczerbku.
Cieniowane klony wizualnie i pod względem sygnatury czakry są nieodróżnialne od oryginału nawet dla dōjutsu, chociaż Uchiha Madara jest w stanie je rozpoznawać. Posiadają własną czakrę i mogą wykonywać techniki, w tym tworzenie nowych cieniowanych klonów. Po rozproszeniu - od ciosu lub na wolę użytkownika - całe zdobyte doświadczenie i pozostała czakra natychmiast przekazywane są oryginałowi. Ta właściwość jest aktywnie wykorzystywana do zbierania danych wywiadowczych: klon przenika na wrogie terytorium, wykonuje zadanie i rozprasza się, przekazując właścicielowi uzyskane informacje.
Kakashi Hatake odkrył, że cieniowane klony są w stanie przyspieszać naukę: godzina treningu z jednym klonem daje dwie godziny doświadczenia po jego rozproszeniu, a setki klonów kompresują tygodnie praktyki w godziny. Jednak kolosalne zużycie czakry i narastające zmęczenie sprawiają, że ta metoda jest dostępna praktycznie tylko dla Naruto.
W walce klony służą do odwracania uwagi, okrążania i przewagi liczebnej. Między oryginałem a klonami utrzymuje się cienka więź, pozwalająca na koordynację działań.