Czarny Chidori to wzmocniona wersja Chidori, którą Sasuke Uchiha stosuje, czerpiąc chakrę ze swojej Przeklętej Pieczęci Nieba. Aktywacja pieczęci czyni tę technikę znacznie potężniejszą od zwykłego Chidori, zmienia jej kolor na ciemniejszy, a charakterystyczny przenikliwy dźwięk przekształca się w trzepot skrzydeł. Podczas używania pierwszego etapu pieczęci Chidori w większości przypadków przybiera fioletowy odcień. Sasuke użył tej wariacji podczas decydującej walki z Naruto Uzumakim w Dolinie Końca.