W okresie służby w ANBU charakter Kakashiego uległ drastycznym zmianom, przeobrażając się z radosnego i odważnego nastolatka w zimnego, zamkniętego profesjonalistę. Śmierć Rin stała się punktem zwrotnym, który zniszczył jego poprzednie światopogląd i pozostawił głęboką ranę duszę.
Zimny i odosobniony — to główne cechy tego okresu. Kakashi przestał okazywać emocje, stając się prawie bezużytecznym wobec tego, co działo się wokół. Rzadko mówił, woląc ciche wykonywanie zadań zamiast rozmów i okazywania ludzkiego ciepła. Jego spojrzenie stało się puste, jakby patrzył przez ludzi, nie dostrzegając ich.
Bezwzględność wobec wrogów przejawiała się w jego pracy. Dzięki Sharinganowi i wysokiemu poziomowi umiejętności, Kakashi skutecznie niszczył cele, nie odczuwając wyrzutów sumienia. Stał się idealnym narzędziem w rękach wioski — dokładnym, cichym i śmiertelnym. Pseudonim „Kopiujący ninja” w tym okresie nabrał mrocznych konotacji, gdyż rzeczywiście kopiował techniki wrogów, aby zabijać ich własną bronią.
Ślepe wykonywanie rozkazów zastąpiło mu własną wolę. Utraciwszy sens istnienia, Kakashi przestał zadawać sobie pytania o moralność misji, po prostu wykonując wszelkie rozkazy dowodzenia. Był to jego sposób na ukaranie siebie — pracą aż do wyczerpania, zagłębieniem się w ciemność, gdzie nie pozostawało miejsca na cierpienie.
W nim wrzał konflikt poczucia winy i pragnienia odkupienia. Każda misja, każdy zabity wróg odbierany był jako próba zagłuszenia bólu utraty. Nosil maskę nie tylko na twarzy, ale i na duszy — ukrywając się za profesjonalizmem przed własnymi demonami.
Jednak nawet w ten mroczny okres w Kakashim pozostawała iskry jego dawnego ja. Wierność towarzyszom — choć mocno stłumiona — nadal określała jego działania. Czwarty Hokage Minato próbował przywrócić go do światła, a te próby stopniowo przynosiły efekty, pozwalając Kakashiemu nie całkowicie zagubić się w ciemności ANBU.
Ten okres wykształcił w Kakashim wewnętrzną dyscyplinę i samokontrolę, które pozostały z nim na całe życie, ale także pozostawił głębokie ślady psychologiczne, których echa przejawiały się nawet w dorosłym wieku — w jego nawykach spóźniania się, leniwym tonie i ukrytej za maską uśmiechu smutku.
