우치하 시스이는 뛰어난 닌술 능력을 발휘하여 '순신 노 시스이' 즉 '순간이동의 시스이'라는 별명을 얻을 수 있었다.
순간 이동 기술(순신 노 주츠)
시스이의 주요 전문 분야로 그를 전설로 만든 기술이다. 모든 다섯 가지 기본 자연 변환을 mastery하고 차크라 제어에 뛰어난 능력을 갖추어 엄청난 거리를 이동하면서 뒤에는 오직 녹색 자국만 남길 수 있었다. 그의 이동 속도는 매우 빨라 상대가 그의 움직임을 알아채기도 전에 이미 지나가버렸다.
원소 기술
우치하 일족의 진정한 일원으로서 시스이는 화염_release를 능숙하게 다뤘다. 그의 대표 기술인 대화염 삼식 화(가톤: 고우카 멧쿄큐)는 다수의 표적을 동시에 없앨 수 있는 거대한 불길을 만들어냈다. 또한 일족의 전통 기술인 대화염 구와 화염 용을 사용했다.
망쿄우 샤링안과 독특한 능력
망쿄우 샤링안을 각성한 시스이는 세계에서 가장 강력한 기술 중 하나인 코토아마츠카미에 접근할 수 있었다. 이 독특한 환술 기술은 대상에게 어떠한 생각도 주입할 수 있어 그 정신을 완전히 장악하면서도 피해자는 자신이 자의적으로 행동하고 있다고 믿게 만들었다. 이 능력은 시선 접촉이 필요하지 않았고 완전히 незаметно 작동했다.
무기 사용
시스이는 쿤아이와 쇼리켄을 순간이동 기술과 결합시켜 lightning-fast한 공격을 구사하는 데 능숙했다. 또한 안부 임무에서의 참여를 통해 검을 다루는 능력도 갖추고 있었다.