天候操作（ウェザーコントロール）は、ヨタとその一族が使う秘伝忍術である。この能力は、自然条件に関係なく自分の周囲の天候を変えることを可能にする。ヨタは雨、雪、稲妻、風、さらには太陽光さえも作り出し、それらを武器や防御に変えることができる。彼は各効果の射程と方向を制御し、複数の効果を同時に使うこともできる。この術の作用は屋外に限定されず、ヨタは比較的閉鎖された空間でもそれを発動させることができる。
雨は弱くも強くも降らせることができ、単一の標的に打ち込むこともできる。そうした雨は相手からチャクラと生命力を吸い取り、悲哀をもたらす。ヨタは水から強力に圧縮された水流を形成して、相手を阻止、拘束、あるいは締め付け、また大きな力で打つ巨大な水泡を作る。雪はほぼ瞬時に周囲すべてを凍らせる強力な吹雪に変える。ヨタの稲妻は紫色で速く、どの方向からでも撃つことができ、目標を追尾する。命中は致命的であり、ヨタは望めば目標を完全に破壊することもできる。それが彼自身であってもだ。彼は口笛で風を操る。集中した竜巻や、切断し傷つける複数の渦を作り出す。彼の風は、九尾のチャーラ・モードのナルトに触れるほど十分に強い。太陽光は戦闘には使わないが、その周囲には急速に花が咲き誇る。
