輪廻眼は三大瞳術の中で最も尊ばれ、最強の瞳術である。伝説によれば、混沌の時代にこの眼の持ち主は、平和をもたらす創造の神として、あるいは全てを無に帰す破壊の神として天から降臨するという。外見上、輪廻眼は眼球上に広がる同心円によって特徴づけられる。
地球上で最初にこの瞳術を有していたのは、六道仙人として知られる大筒木ハゴロモであった。彼は輪廻眼の力を使って十尾から世界を救い、現代の忍術の前身である忍宗を創設した。そのため、彼の眼と彼自身は死後何世紀も経っても神話として崇められた。輪廻眼の覚醒は、写輪眼の所有者がハゴロモのチャクラを得ることで可能となる。一つの道は、彼の息子たちであるインドラとアシュラのチャクラを融合させることである。これはうちはマダラが千手柱間の肉を自らの体に移植することで成し遂げた。しかし、眼が輪廻眼に変化したのは数十年後、彼の人生の黄昏時であり、同時にイザナギで失った視力が戻った。第二の道は、ハゴロモの霊から直接チャクラを得ることである。うちはサスケの場合、左目が六つの巴を持つ輪廻眼となり、天照を含む万華鏡写輪眼の能力を保持した。過度に使用すると巴が一時的に消え、眼が弱まり、もう一方の眼の万華鏡写輪眼と須佐能乎が封じられる。輪廻眼の移植は可能である。マダラは生前、密かに両眼を幼いナガトに移植した。ナガトはうずまきの血筋により、その力を完全に引き出すことに成功した。ナガトの死後、左眼はうちはオビトが手にしたが、両眼の力は自分には荷が重すぎると自覚していた。
輪廻眼は膨大なチャクラと視覚力を備え、チャクラの流れや目に見えない障壁を見通し、あらゆる術と五つの基本性質変化を容易に習得できる。この眼だけが六道の石碑を完全に読み解くことができる。主要な能力は六道の術であり、六つの異なる力を与える。天道は引力と斥力を操り、修羅道は体を機械的に変化させ、人道は魂を抜き取り、畜生道は様々な生き物を召喚し、餓鬼道はチャクラを吸収し、地獄道は閻魔へのアクセスを開く。第七の外道は生と死を司り、死者を蘇らせ、遠隔でチャクラを送信しペイン六道を操るための黒い受信機を作り出すことができる。ペイン六道は六つの体であり、それぞれが六道の術の一側面を使用し、互いに視野を共有し、召喚された動物や閻魔とも視野を共有する。
輪廻眼は外道魔像を召喚し、その封印を解くことができ、十尾を体内に封印してその人柱力となることができる。眼の所有者は輪廻写輪眼を覚醒させ、無限月読を発動できる。一方、別の保持者はその光を反射し、須佐能乎で味方を守ることもできる。個々の所有者の独自の術としては、うちはサスケの天手力（対象や物体と瞬時に位置を交換する）や、マダラのリンボ（輪廻眼にのみ視認でき、六道のチャクラにのみ脆弱な不可視の実体影を作り出す能力）がある。
