十二歳のシスイは、忍びの中の真の天才にのみ見られる、子供の無邪気さと大人の責任感という稀な組み合わせをすでに示している。忍の称号を得たにもかかわらず、彼は活発で開かれた性格を保ち続け、それは宇智波一族の暗い評判とはっきりと対照的である。シスイは周囲の人々と容易に交流し、自分を他人より上位に置くことはなく、卓越した能力や目覚めた万華鏡写輪眼があるにもかかわらずそうだ。
彼の心の広さと助ける準備ができている姿勢は、特に才能ある子供たちの中での人気者にし、例えばイタチのような者にとって、シスイは師匠であり年上の友人となる。彼は木ノ葉隠れの理想を真摯に信じ、個人的な野心や一族の利益にかかわらず、村を守ることこそが自分の使命だと考えている。
その優しさにもかかわらず、シスイは鋼の意志を持ち、他の人々が戸惑うような場面でも重大な決断を下す能力がある。彼の平和主義的な性格は、大切な人の安全にかかわるときには、果断で妥協を許さない姿勢を妨げない。彼は名声や公の認知を避けて影から行動することを好み、これがANBUの哲学―目に見えぬ盾であり、輝く武器ではない―と共鳴する。
シスイは発達した知性と直感を持ち、それによって対立の早期段階を見極め、平和的な解決に向けて努めることができる。彼の速さ、「瞬身」と呼ばれるものは、ただの戦闘の腕前を表すだけではなく、常に一歩先を行こうとする姿勢―災害に反応するのではなく、それを防ぐために―をも反映している。
