Susanoo est la capacité la plus puissante accessible à celui qui a éveillé le Mangekyō Sharingan et maîtrisé sa puissance dans ses deux yeux, et qui se transmet dans le clan Uchiwa de génération en génération. Elle matérialise un gardien humanoïde géant à partir du chakra de l'utilisateur, qui entoure son hôte et agit comme une extension de sa volonté — attaque, défend et applique des techniques. Susanoo se développe par étapes : d'abord apparaît la structure squelettique, puis les muscles et la peau se forment, le torse complet se constitue, et aux stades avancés s'ajoutent l'armure, les jambes et, enfin, le colossal Susanoo Achevé, qui atteint la taille d'un bijū et gagne des ailes pour voler.
L'activation de la technique nécessite une dépense colossale de chakra et provoque une sensation de douleur dans chaque cellule du corps, qui s'intensifie lors de la transition vers des formes plus abouties. Susanoo peut sélectivement laisser passer à travers lui les attaques de l'utilisateur lui-même et de ses alliés, mais il ne régénère pas en cas de dommages — la restauration n'est possible que par la dissipation et la reformation, ou par la progression vers le stade suivant. La protection physique est pratiquement absolue, mais la technique ne protège pas des attaques qui affectent directement les organes sensoriels, comme les ondes sonores ou le genjutsu. Aux stades sans jambes apparentes, la partie inférieure du corps reste vulnérable, et on peut s'approcher sous Susanoo par exemple par le sol, tandis qu'un adversaire parvenant à attraper l'utilisateur peut l'extraire de sa protection.
Chaque possesseur du Mangekyō reçoit une incarnation unique par sa couleur, son apparence et son armement. Itachi Uchiwa possédait l'Épée Totsuka, qui scelle tout ce qu'elle transperce, et le Miroir Yata, qui change ses propriétés pour refléter toute attaque. Sasuke Uchiwa est armé d'un arc et de flèches, dont les propriétés peuvent être renforcées par les flammes noires ou la foudre ; son Susanoo Achevé acquiert un casque démoniaque au long nez de tengu. Madara Uchiwa utilisait un Susanoo à deux visages avec quatre bras et des lames courbes capables de fendre l'ennemi. Le Susanoo Achevé de Madara tranchait des pics montagneux à distance d'un seul coup de katana. On sait également qu'Indra Ōtsutsuki, Kakashi Hatake et Hagoromo Ōtsutsuki ont utilisé cette puissance, le Susanoo de Kakashi portant des cicatrices reproduisant celles de son hôte.
