Le Tomoe Rinnegan est une forme unique de Rinnegan, éveillée dans l'œil gauche de Sasuke Uchiwa après avoir reçu la moitié du chakra de Hagoromo Ootsutsuki. Sa particularité réside dans les trois tomoe sur chacun des deux cercles internes de l'œil, soit six au total. Contrairement au Rinnegan ordinaire, ce dōjutsu n'est pas capable de basculer vers d'autres versions de dōjutsu (comme chez Madara), mais conserve toutes les capacités du Mangekyō Sharingan gauche de Sasuke, y compris l'Amaterasu et divers genjutsu.
Les capacités du Tomoe Rinnegan incluent tout l'éventail de la Technique des Six Voies : attraction et répulsion via la Voie des Deva, absorption du chakra via la Voie des Preta, création du Chibaku Tensei, et ainsi de suite. L'œil permet de voir les objets invisibles, de réfléchir la lumière du Tsukuyomi Infini et de transformer le Susanoo en réceptacle pour le chakra des bêtes à queue. La capacité unique est la reconnaissance de formes, permettant d'analyser les schémas dans les codes et les textes, en extrayant un maximum d'informations d'un minimum de symboles. Le dōjutsu spatio-temporel signature Amenotejikara échange instantanément deux objets dans un certain rayon.
