Quand Uzushio tomba, le grand clan Uzumaki cessa d'exister en tant qu'entité unifiée, se dispersant à travers les terres shinobi sous forme de réfugiés. Leurs connaissances en matière de sceaux, autrefois une fierté, ne devinrent plus qu'un outil de survie dans un monde cruel où chacun ne pensait qu'à soi. Ceux qui restèrent en vie cachèrent leurs origines, craignant la persécution ou désirant utiliser les traditions étrangères comme un bouclier. À l'époque de Shippuden, les Uzumaki de sang pur se comptent sur les doigts d'une main, et ils ignorent souvent même l'existence les uns des autres. De ce grand clan ne subsistent que de rares îlots de mémoire génétique, dispersés parmi différents villages et destins.