El Tomoe Rinnegan es una forma única de Rinnegan, despertada en el ojo izquierdo de Sasuke Uchiha tras recibir la mitad del chakra de Hagoromo Ōtsutsuki. Su rasgo distintivo son tres tomoe en cada uno de los dos círculos internos del ojo, seis en total. A diferencia del Rinnegan común, este dōjutsu no es capaz de cambiar a otras versiones de dōjutsu (como el de Madara), pero conserva todas las habilidades del Mangekyō Sharingan izquierdo de Sasuke, incluido Amaterasu y diversos genjutsu.
Las capacidades del Tomoe Rinnegan incluyen todo el espectro de la Técnica de los Seis Caminos: atracción y repulsión mediante el Camino Deva, absorción de chakra mediante el Camino Preta, creación del Chibaku Tensei, y así sucesivamente. El ojo permite ver objetos invisibles, reflejar la luz del Tsukuyomi Infinito y convertir a Susanoo en un recipiente para el chakra de las bestias con cola. Su habilidad única es el reconocimiento de patrones, que permite analizar regularidades en códigos y textos, extrayendo el máximo de información del mínimo de símbolos. El dōjutsu espacio-temporal insignia Amenotejikara intercambia instantáneamente dos objetos en un radio determinado.