Uchiha Shisui besaß herausragende Fähigkeiten im Bereich Ninjutsu, was ihm den Spitznamen «Shunshin no Shisui» – «Shisui des Augenblickstransfers» – einbrachte.
Die Technik des Augenblickstransfers (Shunshin no Jutsu)
Die Hauptspezialisierung Shisuis, die ihn legendär machte. Dank außergewöhnlicher Beherrschung der Chakra und der Beherrschung aller fünf grundlegenden Naturverwandlungen konnte er über enorme Entfernungen teleportieren, wobei er lediglich eine grüne Spur hinterließ. Seine Bewegungsgeschwindigkeit war so groß, dass Gegner seine Bewegungen oft gar nicht wahrnehmen konnten.
Elementartechniken
Als wahrer Vertreter des Uchiha-Clans beherrschte Shisui das Feuer-Element hervorragend. Seine Signaturtechnik – Großes Feuer des Vernichters (Katon: Gōka Mekkyō) – erzeugte eine massive Flammenwand, die mehrere Ziele gleichzeitig zerstören konnte. Zudem beherrschte er klassische Techniken des Clans: Große Feuerkugel und Feuerschlangen-Technik.
Mangekyō Sharingan und einzigartige Fähigkeiten
Durch das Erwachen des Mangekyō Sharingan erhielt Shisui Zugang zu einer der stärksten Techniken der Welt – Kotoamatsukami. Diese einzigartige Genjutsu-Technik ermöglichte es, beliebige Gedanken beim Ziel einzupflanzen und dessen Geist vollständig zu kontrollieren, wobei das Opfer überzeugt blieb, nach eigenem Willen zu handeln. Diese Fähigkeit erforderte keinen Augenkontakt und funktionierte völlig unbemerkt.
Waffenbeherrschung
Shisui beherrschte Kunai und Shuriken meisterhaft und setzte sie in Kombination mit der Technik des Augenblickstransfers für blitzschnelle Angriffe ein. Zudem beherrschte er das Schwert, wie seine Teilnahme an ANBU-Missionen belegt.
